16s/宏基因测序服务

内容简介

16S/18S rDNA分别是编码原核/真核细胞核糖体小亚基的DNA序列，而真菌18S、5.8S和28S rDNA基因间隔序列称为ITS，ITS分为两个区域：ITS1位于真核生物rDNA序列18S和5.8S之间，ITS2位于5.8S和28S之间。细菌的16S rDNA，真核微生物的ITS或18S rDNA序列，既有结构与功能上的高度保守性，又有种属间高变性的特征，非常适合研究环境微生物群落结构组成、挖掘样品间微生物差异、研究其物种多样性。

环境微生物多样性检测是指通过对环境中微生物的16S rDNA 、18S rDNA或ITS高变区的PCR扩增产物进行高通量测序并分析该环境下微生物群落的多样性及特征，因此微生物扩增子测序又被称为微生物多样性测序。常用于疾病与人体肠道、表皮微生物的关系研究，肠道、瘤胃（如产甲烷菌类群）与动物健康/营养消化的研究等领域。

宏基因组学（Metagenomics），利用新一代高通量测序技术（NGS）以特定环境下微生物群体基因组为研究对象，在分析微生物多样性、种群结构、进化关系的基础上，可进一步探究微生物群体功能活性、相互协作关系及与环境之间的关系，发掘潜在的菌群基因功能意义。与传统微生物研究方法相比，宏基因组测序技术规避了绝大部分微生物不能培养、痕量菌无法检测的缺点，因此近年来在微生物学各个领域研究中得到了广泛应用。

技术原理

16S/18S/ITS扩增子测序，首先提取样本全基因组DNA，使用特异性引物扩增出目标区域序列，构建文库后使用Illumina Hiseq2500进行PE250测序，从而获得目标区域的序列数据信息。

宏基因组测序，提取样本全基因组DNA，片段化后制备300bp测序文库，然后使用Illumina测序平台进行测序，从而获得全部的微生物基因组序列数据信息。

技术优势